Nhà thờ Công giáo Motomachi là công trình được tái thiết vào năm 1910 từ tòa nhà ban đầu xây khi nhà truyền giáo người Pháp Mermet de Cachon đặt chân đến Hakodate năm 1859. Công trình mang phong cách kiến trúc Gothic thế kỷ 12, nổi bật với tháp chuông lớn mái nhọn vươn cao ở độ cao 33m. Đây là một trong những nhà thờ Công giáo có lịch sử lâu đời nhất Nhật Bản, cùng với các nhà thờ được xây dựng tại Yokohama và Nagasaki.
Bước vào thánh đường, bạn sẽ bắt gặp ngay trần nhà cao và những mái vòm nhọn. Trên trần xanh lam pha giữa sắc xám và xanh, những ngôi sao bạc đa giác được điểm xuyết khắp nơi. Cùng với các bức phù điêu về cuộc khổ nạn trên tường và kính màu, tất cả tạo nên vẻ đẹp choáng ngợp của đại thánh đường. Khi biết rằng toàn bộ bàn thờ chính, bàn thờ phụ và các bức phù điêu trong đại thánh đường là quà tặng từ Giáo hoàng Benedict XV, không gian nơi đây càng gợi cảm giác trang nghiêm hơn. Những tác phẩm này được chế tác tại một xưởng thủ công danh tiếng của Ý, nơi các sản phẩm đã được công nhận có giá trị như tài sản văn hóa quan trọng ở nhiều quốc gia.